刚一进驻新亭，桓玄便命卞范之带人去逮捕会稽王父子。

卞范之离开不久，天子使臣黄门郎王谧来到新亭拜会桓玄。

与王谧密谈后不久，桓玄率军正式进驻京师建康。

天子当即下诏免除会稽王父子一切职务，并任命桓玄为总百揆（统管文武百官）、侍中、都督中外诸军事、丞相、录尚书事、扬州牧，兼徐州刺史，其余荆州、江州刺史不变。

而后又加黄钺、羽葆鼓吹、班剑二十人，设置左右长史、司马、从事中郎四人。

上殿时，允许其带全副武装的甲士二百人担任护卫。

桓玄将扬州、徐州刺史拿到手后，又任命哥哥桓伟为荆州刺史，堂兄桓谦为尚书左仆射、加中军将军。

任命桓谦之弟桓修为都督六州诸军事、右将军、徐州兖州刺史、假节。

任命通风报信的堂兄桓石生为前将军、江州刺史；卞范之为建武将军、丹阳尹。

其姐夫殷仲文也被桓玄任命为侍中、兼领军将军。

桓玄除了在朝廷内外大肆安置自己亲信外，对于改投自己的世家名士、朝廷大臣，也都委以重任。

比如王谧，因其与桓玄交好，直接从黄门郎一路高升至中书监，领司徒，封武昌县公。

在此前后，世家名士羊孚也从京口前来投奔桓玄。

羊孚从小与桓玄交好，此时正任兖州别驾，听说桓玄攻入京师，立即从京口跑了回来。

除了这些故旧之外，对于曾经一些仇人，桓玄也表现出宽宏大量。

数年前，年轻气盛的桓玄，在当时的荆州刺史殷仲堪面前跃马挺枪。

殷仲堪的参军刘迈曾指斥桓玄，差一点被桓玄派人所杀。

没想到今天再见到刘迈，桓玄不仅没有怪罪对方，还对其委以重任。

桓玄此举乃是为了安抚京师内各个世家大族，因为王谧、羊孚、刘迈等人几乎代表了目前京师中各个派系。

而各个门阀士族其实也愿意看到桓玄驱除司马道子父子专权，恢复司马氏与各个门阀之间共治的局面。

但显然他们都小觑了桓玄，如今桓玄只是初来乍到，不敢将野心暴露出来，才不得不伪装成一幅礼贤下士的样子。

其实在桓玄内心，他早巴不得马上取代晋室，篡权上位。

但不管怎么说，至少到目前为止，桓玄做得十分出色，赢得了朝野内外一致称赞。

连后世史书都称，桓玄初入京师时，斥去奸佞，提拔贤才，京师上下都十分高兴，都希望他能结束当前混乱局面。

得志后的桓玄动作迅速，立即对司马道子父子一党展开清算。

数日后，也就是在桓玄进入京师的第四天，有人举报会稽王司马道子酗酒、不孝，按照法律，应当被斩首。

随后天子下诏，将司马道子流放到新安郡，并斩杀司马元显以及包括世子东海王司马彦璋在内的六个儿子。

除此之外，谯王司马尚之、张法顺、太傅从事中郎毛泰及其弟弟游击将军毛邃、太傅参军荀逊、吏部郎袁遵等会稽王同党悉数被杀。

司马尚之二弟、丹阳尹司马恢之，三弟、辅国将军司马允之，毛泰的四弟、太傅主簿毛遁等人则被流放广州。

原朝廷重臣中，除了王珣、车胤、谢靖、王珣等人因病或其他原因侥幸逃过一劫外，大部分人都被桓玄问罪，或罢官去职，或流放外地。

即使将司马道子流放外地，桓玄依然无法完全放心。

为了永绝后患，桓玄派人将司马道子、司马恢之、司马允之等人诛杀在流放途中。

原本桓玄还要诛杀王诞，却被桓修等人苦苦求情，又说出王诞曾求情的经过，他这才赦免了王诞，只是将其流放广州了事。

桓玄在流放了会稽王后，又将其诛杀，可谓狠毒。

而朝野内外看到桓玄大肆株连，顿时人人自危，连刚刚被罢免了司徒职位的琅琊王也是惶恐不安。

只不过如今桓玄掌权，他再也不能随意出入宫中，无法向刘穆之讨教对策。

可他哪里知道，当桓玄入主京师后，刘穆之早将琅琊王抛之脑后，如今正一门心思地要帮河西弄到出征益州的大义。